灵芝孢子呈褐色卵形，具双层壁，褐色内层有许多针状小突起伸入透明光滑的孢子壁外层。一般的化学和物理方法很难打破灵芝孢子的双层壁，因此限制了对其化学成分、生物活性成分的研究。
灵芝孢子非常微小，而且带有坚硬的几丁质纤维素外壳，不宜直接为人体吸收消化的有效物质，科学实验证实，服用未破壁的孢子，只有10%~20%的有效成分能被人体吸收，而破壁之后有效成分吸收率在90%以上。
由于灵芝孢子孢壁独特的结构，必须采用先进的破壁技术和处理方法，通过人为的将其外壁破碎之后，使其更加容易消化吸收纤维素壁内的营养物质。